MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011989	GCT	2	6	320252	320257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147299
5502	NC_011989	GTTCG	2	10	320268	320277	0 %	40 %	40 %	20 %	222147299
5503	NC_011989	CAAA	2	8	320538	320545	75 %	0 %	0 %	25 %	222147300
5504	NC_011989	ATGGC	2	10	320659	320668	20 %	20 %	40 %	20 %	222147300
5505	NC_011989	TCG	2	6	320737	320742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147300
5506	NC_011989	TCG	2	6	320818	320823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147300
5507	NC_011989	GGGCG	2	10	320894	320903	0 %	0 %	80 %	20 %	222147300
5508	NC_011989	GCT	2	6	320906	320911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147300
5509	NC_011989	GC	3	6	320929	320934	0 %	0 %	50 %	50 %	222147300
5510	NC_011989	TTG	2	6	321054	321059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147300
5511	NC_011989	CTG	2	6	321123	321128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147300
5512	NC_011989	GCC	2	6	321219	321224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147300
5513	NC_011989	TGA	2	6	321239	321244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147300
5514	NC_011989	CTGG	3	12	321293	321304	0 %	25 %	50 %	25 %	222147300
5515	NC_011989	GTC	2	6	321314	321319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147300
5516	NC_011989	ACTG	2	8	321326	321333	25 %	25 %	25 %	25 %	222147300
5517	NC_011989	TCA	2	6	321356	321361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147300
5518	NC_011989	GAC	2	6	321386	321391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147300
5519	NC_011989	GGA	2	6	321449	321454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147301
5520	NC_011989	GCA	2	6	321478	321483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147301
5521	NC_011989	GTTG	2	8	321493	321500	0 %	50 %	50 %	0 %	222147301
5522	NC_011989	GTC	2	6	321549	321554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147301
5523	NC_011989	AGA	2	6	321580	321585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147301
5524	NC_011989	CG	3	6	321661	321666	0 %	0 %	50 %	50 %	222147301
5525	NC_011989	GTT	2	6	322062	322067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147302
5526	NC_011989	CTG	2	6	322071	322076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147302
5527	NC_011989	TCC	2	6	322079	322084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147302
5528	NC_011989	CAG	2	6	322183	322188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147302
5529	NC_011989	AGGGG	2	10	322306	322315	20 %	0 %	80 %	0 %	222147302
5530	NC_011989	CGG	2	6	322371	322376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147302
5531	NC_011989	CAG	2	6	322468	322473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147302
5532	NC_011989	CAGG	2	8	322480	322487	25 %	0 %	50 %	25 %	222147302
5533	NC_011989	CAG	2	6	322516	322521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147302
5534	NC_011989	TGA	2	6	322663	322668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147303
5535	NC_011989	TTC	2	6	322677	322682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147303
5536	NC_011989	CAG	2	6	322775	322780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147303
5537	NC_011989	TCG	2	6	322818	322823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147303
5538	NC_011989	ACC	2	6	322836	322841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147303
5539	NC_011989	TTC	2	6	322877	322882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147303
5540	NC_011989	TTCT	2	8	322892	322899	0 %	75 %	0 %	25 %	222147303
5541	NC_011989	CCGA	2	8	322969	322976	25 %	0 %	25 %	50 %	222147303
5542	NC_011989	CGC	2	6	323083	323088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147303
5543	NC_011989	CCG	2	6	323101	323106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147303
5544	NC_011989	CGT	2	6	323110	323115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147303
5545	NC_011989	CGG	2	6	323137	323142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147303
5546	NC_011989	GCG	2	6	323161	323166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147303
5547	NC_011989	GAG	2	6	323181	323186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147303
5548	NC_011989	ATG	2	6	323256	323261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147303
5549	NC_011989	ATC	2	6	323417	323422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147303
5550	NC_011989	CAT	2	6	323438	323443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147303
5551	NC_011989	GCCGAA	2	12	323471	323482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147303
5552	NC_011989	TGG	2	6	323515	323520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147303
5553	NC_011989	GAG	2	6	323879	323884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147304
5554	NC_011989	CCA	2	6	323949	323954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147304
5555	NC_011989	CCGG	2	8	323989	323996	0 %	0 %	50 %	50 %	222147304
5556	NC_011989	CTGC	2	8	324020	324027	0 %	25 %	25 %	50 %	222147304
5557	NC_011989	CGC	2	6	324072	324077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147304
5558	NC_011989	GC	3	6	324094	324099	0 %	0 %	50 %	50 %	222147304
5559	NC_011989	GATC	2	8	324178	324185	25 %	25 %	25 %	25 %	222147304
5560	NC_011989	CCG	2	6	324199	324204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147304
5561	NC_011989	GAC	2	6	324224	324229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147304
5562	NC_011989	GTT	3	9	324268	324276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147304
5563	NC_011989	GCG	2	6	324317	324322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147304
5564	NC_011989	CCG	2	6	324393	324398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147304
5565	NC_011989	GGGC	2	8	324487	324494	0 %	0 %	75 %	25 %	222147304
5566	NC_011989	ATG	2	6	324519	324524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147304
5567	NC_011989	CCG	2	6	324548	324553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147304
5568	NC_011989	ATG	2	6	324573	324578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147304
5569	NC_011989	GCC	2	6	324807	324812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147305
5570	NC_011989	CAC	2	6	324840	324845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147305
5571	NC_011989	ACG	2	6	324907	324912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147305
5572	NC_011989	CGC	2	6	324976	324981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147305
5573	NC_011989	CCT	2	6	325014	325019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147305
5574	NC_011989	CGG	2	6	325041	325046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147305
5575	NC_011989	GGC	2	6	325054	325059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147305
5576	NC_011989	GAT	2	6	325060	325065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147305
5577	NC_011989	GCG	2	6	325093	325098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147305
5578	NC_011989	CGG	2	6	325299	325304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147305
5579	NC_011989	CA	3	6	325311	325316	50 %	0 %	0 %	50 %	222147305
5580	NC_011989	CGT	2	6	325324	325329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147305
5581	NC_011989	GAG	2	6	325364	325369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147305
5582	NC_011989	GGT	2	6	325420	325425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147305
5583	NC_011989	CGC	2	6	325452	325457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147305
5584	NC_011989	GC	3	6	325456	325461	0 %	0 %	50 %	50 %	222147305
5585	NC_011989	CGGGCG	2	12	325511	325522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147305
5586	NC_011989	CTG	2	6	325612	325617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147305
5587	NC_011989	CCG	2	6	325650	325655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147305
5588	NC_011989	GCC	2	6	325869	325874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147306
5589	NC_011989	CAT	2	6	325879	325884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147306
5590	NC_011989	CGG	2	6	325938	325943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147306
5591	NC_011989	GCG	2	6	325959	325964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147306
5592	NC_011989	GAT	2	6	325965	325970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147306
5593	NC_011989	GGA	2	6	325974	325979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147306
5594	NC_011989	ATC	2	6	326050	326055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147306
5595	NC_011989	GGTTG	2	10	326070	326079	0 %	40 %	60 %	0 %	222147306
5596	NC_011989	GCC	3	9	326107	326115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147306
5597	NC_011989	GGC	2	6	326217	326222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147306
5598	NC_011989	TGC	2	6	326223	326228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147306
5599	NC_011989	CTG	2	6	326236	326241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147306
5600	NC_011989	TCG	2	6	326300	326305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147306
5601	NC_011989	CATTGC	2	12	326316	326327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222147306
5602	NC_011989	CCA	2	6	326351	326356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147306
5603	NC_011989	TGG	2	6	326465	326470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147307
5604	NC_011989	GTG	2	6	326505	326510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147307
5605	NC_011989	GC	3	6	326545	326550	0 %	0 %	50 %	50 %	222147307
5606	NC_011989	GGC	2	6	326567	326572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147307
5607	NC_011989	ATG	2	6	326586	326591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147307
5608	NC_011989	GTG	2	6	326592	326597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147307
5609	NC_011989	GTC	2	6	326637	326642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147307
5610	NC_011989	GTCC	2	8	326662	326669	0 %	25 %	25 %	50 %	222147307
5611	NC_011989	GGC	2	6	326725	326730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147307
5612	NC_011989	GCC	2	6	326784	326789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147307
5613	NC_011989	GCG	2	6	326896	326901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147307
5614	NC_011989	TTTA	2	8	326919	326926	25 %	75 %	0 %	0 %	222147307
5615	NC_011989	CGC	2	6	327049	327054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147308
5616	NC_011989	ATG	2	6	327057	327062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147308
5617	NC_011989	CGA	2	6	327088	327093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147308
5618	NC_011989	GCA	2	6	327156	327161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147308
5619	NC_011989	TGG	2	6	327192	327197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147308
5620	NC_011989	GTCAGC	2	12	327228	327239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222147308
5621	NC_011989	GCG	2	6	327246	327251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147308
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5623	NC_011989	GCTC	2	8	327375	327382	0 %	25 %	25 %	50 %	222147308
5624	NC_011989	GGA	2	6	327497	327502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147308
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5740	NC_011989	CTTT	2	8	332683	332690	0 %	75 %	0 %	25 %	222147312
5741	NC_011989	CGG	2	6	332705	332710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147312
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5855	NC_011989	GATC	2	8	339387	339394	25 %	25 %	25 %	25 %	222147318
5856	NC_011989	TCT	2	6	339506	339511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147318
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5981	NC_011989	CCA	2	6	346948	346953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147327
5982	NC_011989	GCCA	2	8	346954	346961	25 %	0 %	25 %	50 %	222147327
5983	NC_011989	CGAG	2	8	346966	346973	25 %	0 %	50 %	25 %	222147327
5984	NC_011989	CCA	2	6	346978	346983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147327
5985	NC_011989	CGC	2	6	347092	347097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147327
5986	NC_011989	GC	3	6	347222	347227	0 %	0 %	50 %	50 %	222147327
5987	NC_011989	CGG	2	6	347236	347241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147327
5988	NC_011989	GC	3	6	347325	347330	0 %	0 %	50 %	50 %	222147327
5989	NC_011989	ATC	2	6	347373	347378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147327
5990	NC_011989	GCCA	2	8	347444	347451	25 %	0 %	25 %	50 %	222147327
5991	NC_011989	ATC	2	6	347456	347461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147327
5992	NC_011989	CAT	2	6	347551	347556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147327
5993	NC_011989	ATCGCC	2	12	347600	347611	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222147327
5994	NC_011989	GCT	2	6	347690	347695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147327
5995	NC_011989	CGT	2	6	348112	348117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147328
5996	NC_011989	TTG	2	6	348127	348132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147328
5997	NC_011989	GTC	2	6	348138	348143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147328
5998	NC_011989	GCCC	2	8	348145	348152	0 %	0 %	25 %	75 %	222147328
5999	NC_011989	GAT	2	6	348177	348182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147328
6000	NC_011989	GCC	2	6	348374	348379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147328

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